三层瓦楞纸箱在垂直于纸面方向上具有一定弹性，对包装物有缓冲减震作用。这是广泛应用三层瓦楞纸箱制造包装箱的主要原因，但是这种弹性却给印刷带来一定的难度。柔性印版因为是由合成橡胶或树脂作为主体，在印刷过程中能以本身的压缩弹性变形来弥补瓦楞纸的厚薄误差与表面不平，从而满足每张三层瓦楞纸箱的压印要求，墨色比较均匀。柔性版印刷使用网纹辊短墨路传墨系统和水性油墨，纸张由纤维交织而成，其亲水性要比亲油性好，所以只要轻轻接触三层瓦楞纸箱，水性墨就几乎全部被三层瓦楞纸箱吸收，因此墨色均匀、平服、厚实。

柔性版印刷是使用柔性印版，通过网纹传墨辊传递油墨的方法进行印刷。印刷时网纹辊将一定厚度的油墨层均匀地涂布在印版图文部分，然后在压印滚筒压力的作用下，图文部分的油墨层转移到承印物的表面，形成清晰的图文。柔性版三层瓦楞纸箱印刷机的输墨机构通常是两辊式输墨机构。

直接印刷的工艺流程为：三层瓦楞纸箱的生产一纸板柔性印刷一模切开槽一钉箱（粘箱），这种工艺符合快速、方便、环保、经济的原则，目前瓦楞纸柔性版印刷机大多数与压痕开槽联动，完成压痕、开槽、模切、涂胶、制箱、记数等工序。国内瓦楞纸箱的加工大多采用印刷开槽机，该设备由送料、印刷（一次、两次或更多）、开槽、压痕、切角、分切、抽废和堆积等部分组成。

切角开槽安装主要由上、下滚线轮，上、下开槽刀，上、下切角刀和分切刀等组成，上、下滚线轮主要完成三层瓦楞纸箱的纵压线，上、下开槽刀通过上部的凸刀切入下部的凹刀完成三层瓦楞纸箱的开缝；上、下切角刀通过上部的切角刀片和下部的刀垫完成瓦楞纸箱接合处的舌头的成型，分切按规定尺寸进行溜边修整。

开槽的深度要与箱盖规格准确配合，一般切口应超过中心压线，但要小于外雌压线。